压力之下

 

20世纪60年代末,彼德·昂德希尔在加利福尼亚开始了他的科学研究生涯,他最初的研究领域是海洋生物。1981年他在特拉华大学获得博士学位,之后他返回了加利福尼亚,那正是生物技术飞速发展的时期,他从事一些诸如用分子生物技术提取酶等工作。也就在那时,他被遗传学家们建立的令人眼花缭乱的基因图谱深深地吸引住了,那时生物技术产业日趋成熟,而旧金山正是DNA重组所引发的一系列革命的中心。同时,在硅谷及周围,切割、接合基因这一生物学的“副业”,广泛地应用到了计算机产业中。1991年,彼德厌倦了商业研究,他申请到斯坦福大学路卡·卡瓦利一斯福扎实验室做合作研究人。通过面试,实验室的领导层相信他能适应这里严密的组织和相互协作的要求,他被录用了。一开始,彼德在实验室从事mtDNA顺序研究,但他很快对Y一染色体产生了浓厚的兴趣。那时,卡瓦利一斯福扎的实验室是一个令人神往的地方,也是“点燃火种”的地方,我有幸那时在那里做博士后,几乎每周那里都会产生统计学和遗传学分析的新方法,充满了浓郁的学术气氛。20世纪90年代,几乎每一个有重要影响的遗传学家都在斯坦福工作过,或是斯坦福的学生,或是在那里做博士后,如戴维·高斯坦、马克·塞尔史坦德、金力等,这三个人在后面的章节都将会出现。有趣的是,这本书中一个最有影响的人物却是一位化学家。要解释其原因,我们需要对组成基因组的分子有所了解。

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在遗传学家的“工具箱”里,一个最主要的“工具”,是从细胞组织中分离出DNA片断的能力。和蛋白质一样,DNA存在于细胞之中,是一种被称为核昔碱基的线型链条状的组织。就像构成蛋白质的氨基酸一样,DNA的顺序转译生物信息。但是,和蛋白质不同的是,DNA的碱基有4种类型:腺嚓吟(A)、胞嗜陡(C)、鸟嗦吟(G)和胸腺嗜吮(T),我们每个人就像它们的手工作品一样,正是这些碱基构成基因密码,决定我们成为一个什么样的生命个体。就像摩尔斯电码,它用点和破折号来转译信息,DNA也是如此,它的“点和破折号”就是这些核普碱基,它们的数量大约是30亿个。从组织中分离出分子混合物的方法,同样可以用来推断DNA分子中核昔的顺序。这是因为,生物化学技术可以做到,根据核昔的顺序得出一定长度的片断。得出这些片断后,把它们放进胶质状电流产生的矩阵,就可以分离出DNA。因为DNA是负电荷,它们会朝矩阵另一端正电荷的方向移动。有趣的是,在凝胶体的矩阵里,这些片断的运动速度会减慢,因为它们要穿过凝胶微小、迷宫般的通道。速度减慢程度和它们的长度成正比,分子越长速度越慢,因为有更多的组织要从那条微细的通道挤过去。这一切在理论上讲起来非常枯燥,但它的画面真的美丽之极。这种技术被称为定序,过去30年里,几乎每个重要的遗传学成果都用到了定序的技术,这真的是一个艰苦的工作,但它十分有效。

 

定序的一个主要问题是它相当慢,而且,要得到所需要的DNA分子顺序,要进行的生化反应的费用也十分昂贵。为此,遗传学家尝试用更快、更便宜的方法来检测DNA顺序。他们通常的做法,是将一个个体的DNA,与另一个个体的进行比较,而这个的DNA顺序,已经在实验室使用生物化学、凝胶技术检测出了结果,通过比较找出两者间的区别。DNA顺序的不同就是我们的多态性,它们决定着个体的易感疾病、头发的颜色(前提是你没有染发)和其他一切遗传的特点。但是,它们大多数对携带者并无影响,只是我们天生继承下来的“行囊”,是我们血统的制造者。而对人类学家和历史学家来说,这些制造者无疑是一座宝藏。

 

化学家彼德·欧芬纳是一个严肃的奥地利人,他的家乡在靠近因斯布鲁克的蒂罗尔。20世纪90年代,他是斯坦福大学应用高压液相色谱(简称HPLC)技术分离DNA分子研究项目的负责人。他正在尝试用HPLC建立一种新的检测DNA分子顺序的方法,因为比起凝胶技术,它分离分子的速度更快。一天,在遗传学系中午的研讨会上,彼德·昂德希尔读到了欧芬纳对这种新技术的介绍材料,他立刻就感到,它可以解决在寻找Y一染色体多态性上存在的问题。他走上前,问欧芬纳是否愿意与他合作。两位科学家开始了忘我的工作,整整18个月里他们没有周末。

 

两个彼德的合作,最终产生了被称为“变性HPLC”的新技术,或简称为HPLC。它幸运地成了DNA分子的专用技术。因为DNA分子是双螺旋,一对核营链通过碱基之间相互的吸引力彼此缠绕。在DNA的世界里,腺嗦吟和胸腺啥吮永远是一对,胞啥健和鸟嚼吟永远是一对,这正是它们分子结构的特点。也就是说,如果知道了一条螺旋链的核昔顺序,便会自动知道另一条上的。双螺旋链结构有两个作用,第一,它稳定DNA的分子,使它们免受酶和环境压力的破坏,在距今5万年的化石上仍然能找到DNA。我们的细胞里同样有单螺旋的结构,它被称为RNA,由于简单,在这样久远的化石里便找不到它的存在。第二个作用是,两条互为“镜子”的螺旋链保证了对核昔顺序进行“备份”,假如一条螺旋链上出现了一个变化(或者说,一个变异),它对面的螺旋链上相应的核营便和它不再是“完美的一对”,错配的发生,会在螺旋链的一个点上轻轻打下一个“结”,这个“结”很容易被细胞内的校正系统检测到,并且将损坏修补好。

 

dHPLC技术利用HPLC不可思议的灵敏性,就如同细胞内的校正系统一样,当错配的DNA分子通过矩阵时,会因为分子结构异常(这里不再是因为分子的长度)而导致运动速度减慢,因此很容易就被检测出来。如果螺旋链上有一个“结”,其运动的速度便会变慢,因此通过不同的移动图谱,就能将错配的片断检测出来。你可以对几百个核营的DNA片断进行扫描,找出其中的异同之处,又快又经济。这一迷人的新技术,使我们在探索基因的旅程中,迈出了关键性的一大步。

 

这一神奇的技术很快被应用到了医学上,用来检测由基因变异引起的遗传性疾病。但是,如何应用它研究人类迁徙呢?很容易理解,用这个技术研究一个地区不同个体的DNA,找出它们彼此的区别,这样,我们能快速有效地在实验室获得基因多样性图谱,得到司供研究的多种多态性。这一技术产生之前,在Y一染色体上检测出的多态性屈指可数,而现在已经至少发现了400个,而且这个数字每星期都在增加。如果罗勃·多瑞特他们在对Y多态性的研究中能应用这一技术,他们肯定会找到变异的。在科学史上,新的技术无数次使古老的谜题迎刃而解,我们得到的答案常常是惊人的。